Atualmente, a Unifesp oferece 52 cursos de graduação em seus campi. Em 46 deles, não há mais vestibular, e o ingresso é feito através do Sisu. Entretanto, para os cursos de Medicina (SP), Engenharia Química (diurno e noturno – Diadema), Ciências Biológicas (SP e Diadema) e Fonoaudiologia (SP), a Unifesp realiza o sistema Misto: utiliza-se a nota do Enem, mas também é feito um vestibular nos dias 14 e 15/12. Por isso, chama-se “misto”. Atenção: as inscrições para o sistema Misto vão até as 15h do dia 20/10. A taxa de inscrição é de R$ 133,00.